肛瘘的治疗一般以手术治疗为主，药物治疗只适用于围手术期的调理。肛瘘的手术治疗它的方法比较多，有中医的方法，也有西医的，现在也有一些更加微创的手术治疗的方法，要根据不同的人选择不同的治疗方法。总而言之，它的治疗的原则是要正确的找到它的内口，也就是它的原发口，处理内口，就使得内口能够愈合，如果内口不能愈合，或者你找的内口不正确，肛瘘就不能治愈。除了处理内口以外，我们要注意保护肛门功能，因为肛瘘它是从括约肌之间，多数都是牵涉到括约肌之间的一些管道，处理不当会造成肛门的功能受损，出现肛门失禁的一些情况，在临床上也要引起重视。