钩端螺旋体病的肾损害，是多种多样的。外观上可以看到肾肿大，病理表现上可以看到肾小管上皮细胞变性、坏死、间质水肿，可见单核细胞、淋巴细胞浸润和小出血，间质性肾炎是钩体病肾脏的基本病变。临床表现上严重者，可以表现为肾衰竭和各种各样的肾小球肾炎、肾小管肾炎。另外，钩端螺旋体病肾损害时，尿中的钩端螺旋体的数量增加，特别容易通过排尿污染周围环境，人与环境中污染的水接触，是本病的主要感染方式。皮肤，尤其是破损的皮肤和黏膜，是钩体最主要的入侵途径，这些主要是通过排尿污染环境引起的。