脑干结构复杂，脑干肿瘤的临床表现与脑干受压及侵袭部位、程度等有密切关系。最常见的症状及体征为颅内压升高(头痛呕吐)、锥体束征和脑神经功能损害等，病程时间长者可表现为脑积水症状。
一、典型症状
1、颅内压增高症状：由于脑干所处的解剖位置，脑干肿瘤生长时会堵塞环池、第四脑室及中脑导水管等引起脑脊液循环障碍即产生颅内压增高症状及体征，表现为头痛、呕吐和视乳头水肿，其中头痛最为多见。
2、脑干症状(颅神经及长索损害体征)：脑干各部位神经核团及周围脑神经受到压迫和侵犯后出现功能受损症状，主要表现为呃逆、眼震、声嘶、呛咳、面瘫、眼神经损伤、感觉异常、肢体肌力差等。眼震对于脑干病变的诊断具有重要提示意义。
3、小脑症状：主要表现为缄默症、共济失调、小脑语言功能障碍等。脑干病变可出现进行性加重的肢体共济失调、构音障碍等临床表现，多发于中青年。
二、其他症状
除典型症状外，脑干肿瘤患者还会出现一侧肢体无法活动。