面神经炎的后遗症主要表现为面瘫不能完全恢复，可以表现为嘴巴歪斜、眼睛不能完全闭合、流眼泪等等，这是比较常见的早期症状。通过治疗可以逐步的改善，留下轻微的后遗症状。
有一部分患者是因为神经再生以后出现芽枝，形成新的神经环路，造成神经的过度兴奋而出现面肌痉挛的症状。这种情况往往发生在面神经炎以后的数个月，面神经过度异常增生，形成异常神经环路而出现的并发症，称为面肌痉挛。可以通过微创的手术进行去除异常增生的芽枝，给予修复和改善症状。