对于支原体感染的支气管炎，早期使用适当的抗菌药物可以减轻症状以及缩短病程。本病本身是有自限性的，多数病例不经过治疗可以自愈。大环内酯类的抗菌药物为首选，比如红霉素、罗红霉素和阿奇霉素。喹诺酮类的比如左氧氟沙星、加替沙星和莫西沙星等。四环素类也用于肺炎支原体支气管炎的治疗，一般疗程可以是2-3周左右。因为肺炎支原体没有细胞壁，所以青霉素或者是头孢菌素类的抗菌药物对它是无效的。对于剧烈咳嗽者、呛咳者，可以适当的给予镇咳药物。如果本病继发有细菌感染，可以根据痰病原学的检查，选用针对性的抗菌药物治疗。