生殖器官疱疹治疗主要包括保持局部的清洁干燥，每天可以用等渗的生理盐水进行清洗。如果有疼痛严重的，可以口服止痛药，给予精神的安慰。如果有细菌的感染，需要用抗生素药膏。如果局部的疼痛比较明显，需要用5%的利多卡因进行止痛，然后是抗病毒的治疗，可以口服阿昔洛韦、泛昔洛韦之类的抗病毒的药物。主要在于预防，生殖器疱疹预防主要是咨询。如果病人有生殖器疱疹，应当及时的告诉其性伴侣，取得性伴侣的谅解，采取屏障式的避孕措施。改善影响性行为的方式，避免非婚性行为，杜绝多个性伴侣。