造成小孩肛门痛的原因主要有便秘、腹泻，便秘引起的主要是肛裂，腹泻引起的主要是肛周皮炎。便秘引起的肛裂，通常建议就诊于小儿外科，做大便常规，大便能软化，肛裂基本都能好。通常建议在饮食上做出处理，每天将胡萝卜榨汁饮用，配合小儿七星茶饮用，对于便秘的缓解很有好处。
出现肛裂若出血比较多，疼痛感比较厉害，建议配合高锰酸钾消毒液坐浴，会好得快一些。如果是腹泻造成的肛门疼痛、肛周皮炎，建议外用夫西地酸和氧化锌混合涂抹，好得会快些。同时治疗腹泻，推荐口服益生菌，首选推荐是口服布拉氏酵母菌散，效果会比较好。