遗精之后出现尿道刺痛主要是由于精囊炎或尿道炎所引起，炎症是引起刺痛的常见原因，通过进行尿常规检测以及泌尿系B超能够帮助诊断。
在临床中治疗小便刺痛的常见方法，主要是以口服药物为主，包括中药和西药，中药主要选择清热解毒、利尿通淋一类，常用的中药有清浊祛毒丸、泌淋清胶囊或热淋清颗粒。
西药主要是选择抗生素类，主要是针对细菌感染引起的炎症。
中药和西药可以同时使用，能够较快的改善症状，一般服药的时间在2-4周左右。