根据真菌侵入甲的部位以及程度的不同，可以分为不同的类型：其中一型为白色表浅型，致病真菌从甲板表面直接侵入引起，表现为甲板浅层有点状或不规则片状白色混浊，甲板表面失去光泽或稍有凹凸不平。还有一型是远端侧位甲下型，这种类型最为常见，多由于手足癣蔓延而来，真菌从一侧甲廓侵犯甲的远侧前缘、侧缘，并使之增厚，灰黄浑浊，甲板表面凹凸不平或有破损。
还有近端甲下型，真菌多通过甲小皮侵入甲板及甲床，表现为甲半月、甲根部粗糙肥厚，凹凸不平或破损。此外还有全甲毁损型，它是各型甲真菌病发展的最终结果，表现为整个甲板被破坏，呈灰黄、灰褐，甲板部分或全部脱落，甲床表面有残留的角质堆积物。