乳糖不耐受一般分为三种：1、先天性乳糖酶的缺乏；2、继发性乳糖酶的缺乏；3、成人型乳糖酶的缺乏。
先天性乳糖酶的缺乏，是由于乳糖酶先天缺乏、活性不足引起的，发生率与种族和遗传有关，属于常染色体隐性遗传。继发性乳糖酶的缺乏，多发生于肠炎后，肠绒毛顶端在肠炎时受到损伤，出现酶的缺乏。
而于肠炎后出现乳糖不耐受性腹泻，需绒毛下端向上生长至顶端，能分泌足量的乳糖酶后，腹泻方可停止。成人型乳糖酶的缺乏，主要表现为随年龄的增长，乳糖酶活性逐渐下降直至消失，引起乳糖酶不耐受和乳糖吸收不良等症状。