睾丸癌的病因目前尚不是很清楚，在睾丸癌的病因当中，隐睾是重要的致病因素，对于隐睾的病人，睾丸肿瘤的发生率比正常人群要高20-40倍。
反过来说，大概有30%左右的睾丸肿瘤病人曾经患有隐睾，如果在患儿六岁以前行睾丸固定术，能降低睾丸肿瘤的发病机会，但是并不能消除这种可能性。
睾丸的先天发育缺陷，也可能会导致睾丸的恶变，此外，遗传因素在睾丸癌的发生中也具有一定的作用，当直系亲属中患有睾丸癌，睾丸癌的发病率会明显的增高，内分泌功能障碍也与睾丸肿瘤的发生有一定的关系。