膀胱结石的治疗以手术治疗为主，同时进行病因治疗、抗感染及对症治疗。手术的方法分为微创及开放手术两种类型。微创手术是经过尿道把碎石器械放到膀胱内，进行碎石，并把结石取出。微创手术有如下几种：
1、大力碎石钳，用钳子把结石直接夹碎，适合于直径小于两厘米的结石。
2、超声压弹道或者钬激光碎石。
这三种方法具体选用何种方式需要医生根据结石的大小、硬度来进行判断；开放手术则是在小腹的中央切开一个小口把结石取出来，适合于较大的坚硬结石，或者尿道有狭窄，碎石器械不能经过尿道放入到膀胱内。这种情况下是不能做胃肠手术的，所以需要做开放取石。