头皮疣可以通过多种途径消除，以物理疗法、激光疗法、局部治疗为主，具体如下：
首先，物理疗法：可以选择液氮冷冻疗法，此种方法简便、有效，临床常用，常用直接涂抹法，以消毒棉签浸蘸液氮直接压迫皮损处，每次20-30秒，反复三次冷冻，待自然结痂脱落，也可以选择喷射法。
其次，激光治疗：可以选择二氧化碳激光或者高能量超脉冲二氧化碳激光，此类方法创面较大，愈合时间较长，可能会留下瘢痕。
然后，局部治疗：可以选择局部治疗，比如可以选择抗病毒药物，包括酞丁安软膏等，或者可以选择基底部注射干扰素、聚肌胞，也可以选择腐蚀性药物，包括10%水杨酸软膏、5%氟尿嘧啶软膏等。