多发肝囊肿严重与否，要取决于囊肿的大小，以及是否引起相应的并发症。
如果多发性的肝囊肿囊肿巨大，会容易引起压迫的症状，压迫肝脏会引起肝功能的不全，甚至肝功能的衰竭，压迫胃肠道会容易引起进食不畅、恶心、呕吐的症状，向上压迫膈肌、肺部容易引起气促、呼吸困难的症状。
如果囊肿合并出现感染、化脓、出血、胆瘘等情况，也会导致囊肿突然增大或者出现右上腹的胀痛，以及畏冷、寒颤、发热等症状。
需要进一步积极处理，才能够有效缓解患者的症状，特别是针对囊肿较多的多囊肝患者，比较难处理。