补牙洞的过程为使用锋利的高速裂钻快速磨除腐坏牙体组织，在接近牙髓处换用低速球钻，缓慢去除变色牙体组织。尽量保留健康牙质，并作预防性的扩展。
临床使用75%酒精棉球彻底消毒窝洞，干燥后使用棉卷或橡皮障隔离唾液，在洞底放置氢氧化钙进行护髓。然后使用玻璃离子水门汀、复合树脂或银汞合金进行充填。材料未凝固前应清除多余物质，注意恢复邻接关系，避免形成悬突。充填物初步凝固后，使用咬合纸检查有无咬合高点，及时调磨后进行抛光。