室间隔缺损介入后遗症，比如主动脉瓣关闭不全、室间隔修复时有遗漏残缺以及房室传导的阻断。主动脉瓣关闭不全的发生可能是因为先天性的主动脉瓣脱落，或者是因为在手术结束后缝线时扯动主动脉瓣环，引发主动脉瓣的创伤严重导致瓣膜脱垂，会造成患者手术结束后心脏复苏困难严重会使患者死亡。
室间隔缺损在接受手术治疗修补缺陷时，造成遗漏或者手术中缝隙显露导致漏缝，会导致患者术后预后不佳循环不稳定，如发现超声分流应尽快进行第二次手术。心脏房、室的传导位于心尖部的浦肯野纤维内，由三尖瓣和前瓣膜的交界处进入室间隔完成传导，如果进行室间隔缺损的膜周手术后，容易出现房室传导的阻断。