肛周脓肿是常见的肛周感染性疾病，其愈合时间大多是较长的。这是由于肛周脓肿很少是简单的皮肤感染，大多数是由于肛瘘造成的。肛瘘有明显的皮肤表面脓肿，而其内口常常位于直肠内。
由于内口的存在，外口会出现反复感染迁延不愈的表现，这种感染大多数月甚至数年都不会好转，只有经过彻底的肛瘘切除才能根治肛瘘以及相应的肛周感染。因此，对于肛周脓肿治疗多长时间能痊愈，首先要判断脓肿形成的原因。
如果是肛瘘，只有经过彻底的外科手术才能根治肛周脓肿。