淋巴结核的治疗方法是在充分营养支持治疗，以及提高抵抗力的基础上，行早期、规律、全程、适量、联合使用抗结核药物治疗。如果经药物治疗没有产生明显效果，或者窦道形成反复发作者，医生可能建议行相应区域的淋巴结清扫术。
淋巴结核的治疗主要有加强营养、增加高蛋白饮食，特别是畜肉、禽肉、蛋类、鱼、虾等动物蛋白的摄入，锻炼身体、充分休息，可以提高抵抗力。淋巴结核是由结核分枝杆菌感染所导致，所以抗结核治疗是关键。结核药物的使用提倡早期、规律、全程、适量、联合使用，一线抗结核药物包括异烟肼、利福平、吡嗪酰胺，以及链霉素、乙胺丁醇，二线抗结核药物，包括左氧氟沙星、乙硫异烟胺、环丝氨酸、卡那霉素、卷曲霉素等。