急性肠炎的治疗包括对因治疗和对症治疗，首先应该明确急性肠炎的病因，如果是细菌引起的急性肠炎，可以运用抗生素的治疗。如果是病毒引起的急性肠炎，最多的是进行休息，并且补充水跟电解质防止紊乱就可以了，往往有自愈的倾向。
对症治疗主要是针对急性肠炎的症状，如果腹痛严重时可以给予解痉药，比如匹维溴铵。如果腹泻严重也可以给予止泻药，比如蒙脱石散等。急性肠炎要注意的就是腹泻严重有可能会出现脱水的症状，所以轻度的患者可以口服补液盐来防止脱水电解质的紊乱。如果重度的患者需要到医院就诊，给予静脉的输液，以防止水和电解质的紊乱。