虽然靶向治疗能成功降低乳腺癌的复发和转移，但不是100%有疗效，乳腺癌靶向治疗的复发率在40%-50%左右。靶向治疗有一定的适应症，并不是所有的乳腺癌都需要进行靶向治疗，目前靶向治疗主要是针对HER-2阳性的乳腺癌患者，其具有针对性强和副作用小的特点，可以在细胞分子水平上，针对已经明确的致癌位置，设置相对应的治疗药物，药物可以选择性的进入到这些细胞当中而发挥作用，从而使肿瘤细胞死亡，对正常细胞、组织产生的伤害很小，是目前非常理想的治疗乳腺癌的一种方法。
随着双靶向时代的到来，凡是符合单靶向治疗的患者，都可以考虑双靶向治疗，而且曲妥珠单抗加上帕妥珠单抗的双靶向治疗，联合化疗方案，疗效优于单一靶向治疗的药物，尤其是对于淋巴结阳性或激素受体阴性的高复发风险的患者，有更显著的效应。复发和死亡概率大幅度下降25%左右，并且没有显著增加严重毒副作用，靶向药物的应用彻底改变了HER-2阳性乳腺癌的治疗方案和效果。