川崎病本身是一种自限性疾病，大多数是预后良好的，所以对大多数川崎病患儿来说，是不影响以后的生活的。复发多见于1%-2%的患儿，无冠状动脉患儿出院后1个月、3个月、6个月及1-2年进行1次全面检查，包括体格检查、心电图、超声心电图等。
未经有效治疗的患儿15%-25%发生冠状动脉瘤，应该长期的密切随访，每6-12个月1次。另外冠状动脉瘤多于病后2年内自行消失，但常遗留管壁增厚和弹性减弱等功能异常，大的动脉瘤，不宜完全消失，常形成血栓或者管腔狭窄。所以从这方面来说，对于少部分的孩子还是有一定的影响，关键是一定要复查。