输卵管结石确实会引起疼痛，而且疼痛还是比较有特点的，往往表现为突然出现剧烈的腰部、下腹部、会阴部等绞痛性的症状，这种疼痛的强度非常高，很多患者甚至在地上打滚，大汗淋漓、恶心、呕吐，也有一部分患者还会合并有肉眼血尿的问题。结石引起疼痛的原因，最重要的是由于结石进入输尿管后，可能会嵌顿或者滞留于输尿管的某一个狭窄部位，从而引起反射性的输尿管平滑肌肉的强烈痉挛，而这样的肌肉强烈痉挛就会带来一种强烈的、剧烈的疼痛的症状，所以输卵管结石出现疼痛症状是非常常见的，从道理上讲也和结石的活动对于结石输尿管平滑肌的刺激也都是直接相关的。
但是从另外一个角度来讲，如果输卵管结石有疼痛的症状，恰恰说明结石在输尿管内，它是一种缓慢的活动状态，这是排石的表现，所以疼痛本身是有利的现象。临床医生恰恰怕的是输尿管结石而不疼痛的患者，这样的患者往往就意味着结石可能真的已经彻底的停止了运动，甚至彻底的滞留于输尿管的某一个部位，这样的患者往往基本上排石就很困难了，后续可能需要接受体外冲击波碎石，甚至需要接受输尿管镜或者软镜这样的内窥镜手术来进行处理。