深静脉血栓的治疗包括药物治疗、手术治疗两个方面。
药物治疗主要是指抗凝治疗、溶栓治疗、抗凝治疗是深静脉血栓治疗的基石，贯穿整个治疗的整个过程。抗凝常用的药物有华法令、利伐沙班，皮下注射低分子肝素，抗凝可以使血栓减少或者消失，防止血栓蔓延形成肺动脉拴塞；溶栓治疗常用的溶栓药，有尿激酶、rtPA溶栓等一系列溶栓药物。
手术治疗包括切开取栓术、机械碎栓溶栓治疗，切开取栓仅限于下肢深静脉血栓，继发股青肿、股白肿时，才考虑切开取栓治疗，而机械栓碎栓治疗Angiojet，是比较先进的介入方法，可以有效的减少血栓，防止血栓蔓延到肺动脉，还有防止血栓脱落形成肺栓塞的下腔静脉滤器植入术，这些都是血栓的治疗。