尖锐湿疣不是必须需要住院治疗，尖锐湿疣治疗可以院内治疗，也可以院外治疗，往往都需要多次治疗，目前没有公认的最佳治疗方案，也没有某种适合所有患者的治疗方案。
医院外治疗指在家可以自行治疗，主要为咪喹莫特软膏等局部药物治疗，院内治疗指医疗机构内，由医生开展的治疗，主要为物理治疗和手术治疗等。治疗目的为尽早清除肉眼可见的疣体，改善可能有的症状，减少复发，改善精神压力，还有美观需求，大多数患者治疗之后，皮损可以改善或者消退。治疗可能会减少人乳头瘤病毒感染，但很可能不会根除感染。如果选择不治疗，尖锐湿疣可能自行消退，可能保持不变，也可能增多、增大。