慢性肾盂肾炎与急性肾盂肾炎完全不同。它的症状主要分为三个部分：第一个是尿路感染的表现，通常尿路感染表现不是很明显，一般可以有乏力、低热和食欲下降等，也可以间歇性地出现腰痛，有时候会伴有尿频、尿急、尿痛等尿路感染的症状，也可以表现为间歇性的无症状性菌尿。第二个是慢性间质性肾炎的表现，此时会出现肾脏浓缩功能下降，可以出现夜尿增多，尿的次数增多，容易发生口渴。当肾小管的重吸收能力下降时，可以出现低钠和低钾血症。肾功能不全时也可以出现高钾血症，有时候会有肾小管酸中毒的表现。慢性肾盂肾炎以肾小管功能损害为主，通常肾小管损害的程度比肾小球损害程度更为突出。第三个是慢性肾功能不全的表现。当肾脏病发展到终末终末期时，可以出现肾功能不全，此时表现为乏力、水肿、食欲下降、贫血。