角膜炎的治疗原则为积极控制感染，减轻炎症反应，促进溃疡愈合，减少瘢痕形成。细菌性角膜炎宜选用敏感的抗生素进行治疗，可以根据经验以及疾病的严重程度使用对病原体有效的和广谱的抗生素治疗，待实验室检查结果证实病原菌后再调整，给予敏感的抗生素进一步治疗。抗真菌药物仍是治疗真菌性角膜炎的重要手段，但是目前缺乏高效、低毒、广谱抗菌的理想药物，临床上多采用联合给药的方法以提高疗效，病情严重者可以全身给药。单纯疱疹病毒性角膜炎可以选择高选择性的抗疱疹病毒的药物进行治疗，联合应用干扰素可以提高疗效，防止复发也是治疗的重点，但目前尚无特效药物。