单心室患儿的寿命主要是由具体病情和手术情况所决定的。由于心室的畸形，左右心室融合成为单心室，动脉血与静脉血完全混合，对周围脏器的供氧存在严重障碍。所以单心室患者的生存率并不特别高，若不进行手术干预，很多人会在儿童早期死亡，有的人的心室结构相对稳定，病情不严重，可能存活将近二十到三十年。但如果没有手术治疗的单心室，统计下来一般存活不会超过青春期，所以对于该种类型的先心病只有手术才可能使患者生存。主要的手术原理是分离左右两心室或者将主心室孤立负责体循环。