脉络膜骨瘤的病因尚不明确，有人认为本病是由血管瘤骨化而成。脉络膜血管瘤可发生骨化是由于视网膜色素上皮的增殖和化生，而不产生于血管瘤本身。目前多数人认为本病是由脉络膜内先天残留的原始中胚叶组织发育而来，因而由骨迷离瘤之称。
一、主要病因
1、遗传因素：迷离瘤是一种先天性良性肿块，系由受累部位在正常情况下没有的组织所组成，可见于眼球表面。从病变的组织成分，患者多系年轻人，和发生于没有其他眼病的正常眼等特点来看，脉络膜骨瘤与迷离瘤相似。
2、炎症因素：眼内炎症可致营养不良性眼内钙化和骨化，局限于视乳头周围的脉络膜炎症，可能导致营养不良性钙沉着，最终发展成与脉络膜骨瘤相似的病变。
3、外伤因素：曾有病例发现眼部有外伤史，这样视网膜可能会发生色素上皮的骨样化生。但是大多数脉络膜骨瘤患者是没有外伤史的，有外伤史的患者可能仅仅是巧合。
4、激素因素：大多数妇女在青春期之后被诊断为骨瘤，但也有未到青春期的女孩和男性，均未发现出现内分泌异常。
5、代谢因素：但是在一般情况下，甲状旁腺机能异常引起的是转移性钙沉着，而不是脉络膜骨瘤。
6、环境因素：环境中的毒素、放射线或药物，都有可能导致脉络膜骨瘤，但没有明确某种药物与骨瘤有关。
二、诱发因素
目前诱发脉络膜骨瘤发生的因素尚不明确，但是有零星研究报道怀疑脉络膜骨瘤的发生可能与Stargardt's黄斑病变、息肉状脉络膜黄斑病变、怀孕、复发性眼眶炎性假瘤、眼内炎等有关，但是目前仍没有已经明确的诱发因素。