任何手术都有一定的风险，眼科斜视手术也不例外。常见的有：一、欠矫和过矫。无论欠矫还是过矫，一般都需要二次手术弥补。二、麻醉意外。如果全麻手术，麻醉过浅过深，都对手术的进行和患者身心不利。三、复视。多数情况下，手术后出现的看物体重影问题，会因为双眼视觉的完善，逐渐缓和和消失。极少数情况因为手术大夫没有认真做好术前正位牵拉试验，患者术后的复视时间持续较长，有时需要几个月或者几年的时间才能逐渐适应。另外，还可见出血感染、角膜损伤、鼓膜穿孔、眼肌滑脱、上睑下垂、药物和缝线过敏等等。