伊曲康唑胶囊是广谱抗真菌药，可以用于治疗灰指甲。灰指甲就是甲癣，是由皮癣菌侵犯甲板或甲下所引起的疾病，是皮癣菌病中最顽固、最难治的一种，所以治疗灰指甲的疗程，通常需要较长的时间。一般口服伊曲康唑胶囊时连服七天，休息21天，这为一个疗程。手指甲的灰指甲，通常需要连续两个疗程及以上，脚趾甲的灰指甲，通常需要3-4个疗程以上。
由于伊曲康唑胶囊不溶于水，餐前口服效果不佳，为达到最佳的吸收状态，建议用餐后立即服药，而且是胶囊必须整个吞服。如果用含油量较大的菜汤来服药，能达到最佳的治疗效果，而且建议餐后尽量避免大量饮水。伊曲康唑胶囊大多数是经过肝脏代谢，所以肝功能异常的患者要慎用，而且在用药期间也应该定期的监测肝功。