怀孕三个月肚子有隐隐作痛的感觉要引起足够的重视，要看腹痛是否合并有阴道的出血，是否有先兆流产的迹象，如果没有，要考虑腹痛是否是腹腔内其他脏器疾病引起的。
右上腹的疼痛一般提示胆囊炎以及胆囊结石，右下腹的疼痛往往提示急性阑尾炎，中上腹部疼痛提示胃炎、胃溃疡等疾病，脐周的疼痛伴有腹泻、呕吐等提示急性胃肠炎。因此，孕期出现腹痛，要到正规的医院进行诊治，明确腹痛的原因，才能得到更好的治疗。