卵巢囊肿是否严重要根据卵巢囊肿的性质来决定，卵巢囊肿有不同的种类，临床上较为常见的卵巢囊肿是卵巢生理性囊肿，卵巢生理性囊肿是由于卵巢分泌的激素水平波动所造成的，卵巢生理性囊肿往往出现在月经的后半期，在2-3个周期之后，当月经结束之后再进行复查，卵巢囊肿往往会消失，因此称为卵巢生理性囊肿，卵巢生理性囊肿是不严重的，大多数不需要进行治疗。
卵巢子宫内膜异位囊肿也就是我们常说的卵巢巧克力囊肿，则是女性较为常见的一种引起痛经、不孕不育等严重后果的囊肿，因此对于卵巢子宫内膜异位囊肿要进行积极的随访观察以及治疗。治疗上可以进行手术治疗，也可以进行药物保守性治疗，要根据卵巢囊肿的性质以及临床表现来进行决定。再有就是卵巢的炎性肿物，由于卵巢、盆腔的炎症所造成的卵巢炎性囊肿，也可能会造成慢性盆腔痛甚至引起不孕症，必要的时候也需要进行积极的抗炎甚至手术治疗。