小儿内脏幼虫移行症的治疗要视疾病的发展阶段而定，往往需要进行1~2周的持续性治疗，具体治疗措施是进行药物治疗，常用药物包括泼尼松、左旋咪唑、乙胺嗪。
一、药物治疗
1、泼尼松：根据病情应用肾上腺皮质激素，轻度可口服泼尼松(强的松)，重症患儿可静脉应用地塞米松或琥珀氢化可的松。需要注意用量，并依据情况及时调整剂量，不可以长期应用。
2、左旋咪唑：由于蛔蚴此类寄生虫感染时，需要选择本药进行抗寄生虫治疗，严重肝肾功能受损的患者禁用。
3、乙胺嗪：疑为丝虫感染时需要选择本药进行抗寄生虫治疗，严重肝肾功能受损的患者禁用，并且此类药物不可以长期应用，可使哮喘与肺部体征好转。
二、手术治疗
小儿内脏幼虫移行症无手术治疗。