肌腱炎与腱鞘炎有一定区别，肌腱炎的发作是在肌腱止点，或者肌腱的形成过程中导致无菌性炎症，都是由于运动而引发的无菌性炎症。
腱鞘炎虽然也是由于运动导致的，但由于腱鞘炎比肌腱炎多一个腱鞘，只有肌腱和腱鞘在运动时产生相对摩擦，引发水肿及无菌性炎症才会导致腱鞘炎产生。所以腱鞘炎是由于腱鞘引发的炎症，而肌腱炎是没有腱鞘而引发的炎症。