绿脓杆菌性角膜溃疡的预防主要是针对病因预防，预防关键是避免绿脓杆菌感染，可通过减少眼部外伤、眼药水定期消毒、选择正规机构就诊等措施减少该病的发生。
（1）荧光素、地卡因等常用眼药水，易被绿脓杆菌所污染，应定期消毒以确保无菌。
（2）选择正规隐型眼镜及消毒清洁液，配戴角膜接触镜者要定期及时消毒，加强体育锻炼。
（3）外出活动注意做好个人防护，避免眼部受到外伤引起感染。
（4）眼部外伤后选择正规医疗机构就诊，防止使用消毒不到位的器械引起感染。