乙肝小三阳的携带者每年需要进行血常规、肝功能、乙肝两对半、乙肝病毒DNA、甲胎蛋白、肝脏超声以及肝脏弹性检测，来明确是否有肝炎、肝纤维化、肝硬化，甚至肝癌的发生。
乙肝小三阳携带者如果在随访期间，发现肝功能异常、肝炎的发作，就需要进行积极的抗病毒治疗。
目前一线的抗病毒药物包括恩替卡韦及替诺福韦，能够有效的抑制乙肝病毒的复制，延缓肝纤维化、肝硬化的发展，并且降低肝癌的发生率。
乙肝携带者如果没有出现肝功能的异常，就不需要任何治疗。