女性尖锐湿疣是可以治愈的疾病，大多数患者治疗后，皮疹可以改善或消退，治疗可能会减少人乳头瘤病毒的感染，但很可能不会根除感染。如果选择不治疗，尖锐湿疣可能自行消退，可能保持不变，也可能增多、增大。虽然治疗可能会导致人乳头瘤病毒DNA减少，但还不清楚是否会减少未来的传播。
虽然治疗后尖锐湿疣的复发几率较高，但是大部分患者通过正确治疗，最终可以实现临床治愈，尖锐湿疣治疗的目的是尽早清除肉眼可见的疣体，改善可能有的症状，减少复发，改善精神压力、美观需求。一般治疗可以采取药物治疗和物理治疗联合，如果疗效不佳时，再考虑手术治疗。