由于先天性胃出口梗阻是先天性疾病，可做好相关遗传咨询和孕检。根据婴儿症状，尽早在出生后早期发现并诊断。维持正常的水电解质平衡，术后做好护理措施，预防感染。
（1）定期体检，以达到早期发现、早期诊断、早期治疗。
（2）增强体质、提高自身免疫力，孕妇应注意多休息，多进食富含维生素的新鲜蔬果。
（3）在怀孕期间注意环境卫生和个人防护，以防病毒、细菌影响胎儿发育。
（4）孕期生病不要随意用药，及时到医院进行就医。
（5）男女双方要了解是否存在该病史，如果有应做遗传咨询。