如果两次怀孕都在卵巢局部妊娠，在临床上最常见的原因就是因为有排卵障碍，或者是输卵管功能受损。比如先天性的或者是其他的原因，输卵管上皮的纤毛运动发生了异常，或者是输卵管产生逆向蠕动，这样就会使受精卵出现异常，所以就到达了输卵管部位妊娠。
另外，在临床上如果是输卵管表面产生了蜕膜样的组织，以及卵巢表面有子宫内膜异位症的病灶，这种情况下就有利于受精卵在卵巢局部着床，达到了卵巢妊娠的可能性。在临床上一旦出现卵巢妊娠就要给予相应的治疗，绝大部分在临床上采用的是手术给予治疗。但是，要保留卵巢组织，这样才能周期性的分泌雌激素和孕激素，使女性的身体不会受到相应的影响。