肝性脑病患者如果治疗不及时，患者可能昏迷后一周内出现死亡，如果积极进行治疗，患者可能转为清醒状态。
肝性脑病的治疗方面，首先要积极寻找和去除诱发肝性脑病的原因，如感染、消化道出血、电解质紊乱、脱水，及便秘、蛋白质摄入过量等，需要积极减少来源于肠道氨及其它毒素的产生和吸收，采取的治疗措施包括低蛋白饮食、改变肠道菌群及结肠的环境，应用乳果糖及进行刺激肠道排空等洗肠的治疗方式。还应积极进行营养支持并维持水电解质的平衡，可以应用非蛋白能量进行摄入，也可以选择肠内营养。药物治疗方面可以选择乳果糖及拉克替醇，还可以应用调节神经递质的纳洛酮等药物，以及门冬氨酸鸟氨酸、支链氨基酸、益生菌等，还可以采用非生物学人工肝的方法进行治疗，包括血浆置换、血液灌洗、血液滤过、血液滤过透析等。
建议蛋白质摄入量是1-1.5g(kg/d)，需要注意的是最好吃植物蛋白，植物蛋白要优于动物蛋白，奶制品蛋白也优于动物蛋白。