脑血栓在超急性期，会选用药物进行溶栓治疗，包括rt-PA以及尿激酶。在稳定期和巩固期，会选用抗血小板聚集药物，如阿司匹林、氯吡格雷、双嘧达莫和西洛他唑等。还有调节稳定斑块的药物，通常用的是他汀类的降脂药，阿托伐他汀或者瑞舒伐他汀等。配合着应用祖国的传统中医、中药的治疗，以及神经保护剂的治疗。在治疗的过程中还要注意观察病人的血压、血糖、同型半胱氨酸等指标，进行相应的指导治疗。