因为细菌在医学上分为两大类，一个是革兰氏阳性球菌，一个是革兰氏阴性杆菌，所以，细菌性肺炎的病原菌也分为这两大类。革兰氏阳性球菌这一大类的病原菌，常见的有肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、军团菌。革兰氏阴性杆菌这一大类的病原菌，常见的致病菌为绿脓杆菌、肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌，还有厌氧菌。