在妊娠16-18周的时候，要对预产期年龄小于35岁的女性，进行唐氏综合征的筛查，筛查的目标疾病的是21-三体综合征、18-三体综合征以及开放性神经管畸形。
筛查的血清生化学指标是雌三醇、甲胎蛋白以及绒毛膜促性腺激素(HCG)，任何一项指标，如果超过正常参考值范围，诊断为高风险，认为有胎儿染色体异常发生的风险因素。
HCG如果超过正常值，建议要做进一步的产前诊断。产前诊断目前来说，诊断的金标准是羊水穿刺，染色体的核型分析，这个检查是目前最准确的。另外如果是对于羊水穿刺有禁忌证的孕妇来说，可以进行母体外周血的胎儿DNA，也就是无创DNA的检测，也可以对21-三体综合征做较为准确的筛查。