口腔扁平苔藓的治疗用药，包括局部可以应用肾上腺皮质激素类的药物进行局部的封闭，全身用药也可以应用肾上腺皮质激素治疗，也可以选用口服氯喹等药物进行治疗。
如果怀疑合并有白色念珠菌感染，可以加用抗真菌类的药物。目前临床上应用氯喹最为常见，但是口腔扁平苔藓疾病的发病原因不明确，治疗时间、病程可能非常长，效果并不一定非常明显，需要做好长期治疗的准备。