多囊卵巢综合征的病因目前不明，目前有研究认为主要可能是一种遗传因素或者环境因素的相互作用。多囊卵巢综合征在临床上表现出一种家族聚集性，就有可能在一家中，其姐姐可能也是多囊卵巢综合征患者，妹妹也是，妈妈也是，甚至往上外婆也是，表现出一种家族的聚集性。因此，认为多囊卵巢综合征可能是一种多基因疾病。此外，包括患者的饮食方式，比如过度肥胖，喜欢吃高脂的食物、高热量的食物，或者是作息不规律，或者是长期的压抑、抑郁症，也有可能导致多囊卵巢综合征的发生。此外，目前有些抗癫痫药物，也有可能与多卵巢综合症的发生，还有常使用的一次性杯、一次性用品也有可能诱发多囊卵巢综合征。