肛门镜理论上有可能，实际不会，没有感染的风险。粘膜接触到具备感染性的病毒颗粒，病毒可以通过表皮下的朗格汉斯细胞穿透粘膜屏障，就有可能引起感染。但艾滋病病毒对外界抵抗力极低，常规消毒措施完全可以灭活艾滋病病毒，而目前我国医疗操作都很规范，只要器械按照标准消毒流程处理，就不存在具有感染性的病毒颗粒，也就不存在感染的可能。