手背部位长扁平疣在临床治疗包括如下几个方面：
1、可以涂抹鸦胆子油，以便使疣体坏死脱落；还可以涂抹重组人干扰素α2b软膏、咪喹莫特软膏，起到抗病毒的治疗作用。如果扁平疣数目较多，角化比较明显，可以配合外用他扎罗丁凝胶、维A酸软膏进行治疗。
2、可以选用电离子、二氧化碳激光烧灼的方式进行治疗，以便使疣体能够被破坏，达到相应的治疗目的。
3、可以口服相应的免疫调节药物，如脾氨肽冻干粉、匹多莫德口服液，也可以肌注卡介菌多糖注射液，以便达到调节免疫功能，提高抗病毒能力的治疗目的。