肛裂的病因一直存在争议，包括皮肤撕裂说、栅门说、上皮纤维化学说等，但是肛裂发生最主要的原因是便秘、大便干结，排便时过度用力，导致干结大便撑破肛周的皮肤而形成。
一、主要病因
1、解剖因素：肛尾韧带比较硬、弹性较差，所以大便干结容易撑开形成裂口。
2、感染因素：肛窦炎局部感染，因为肛窦炎发生在齿状线，再往下就是肛管，炎症刺激就形成肛管局部溃疡。
3、外伤因素：大便特别干燥时，临厕怒挣把肛门撑破形成肛裂，是肛裂形成的常见原因，有时产后也可以造成肛门局部裂伤。经常腹泻患者，刺激肛门局部皮肤，可逐渐形成溃疡面。
4、肛管狭窄：先天性肛管狭窄，排便时慢慢形成肛裂。
5、缺血原因：括约肌痉挛时局部缺血，慢慢也可以形成肛裂。
6、肛交：肛交是在肛门内进行的性行为，可能会使肛管发生撕裂伤。
7、精神因素：精神紧张可使肛压升高，以及肌张力升高，故精神因素也可能是肛裂病因之一。
二、诱发因素
1、便秘：大便干硬以及不易排出导致肛裂。
2、日常饮水摄入不足：饮水不足导致肠道内干燥，肠内容物不易排出诱发肛裂。
3、大便时间过长：一部分人群喜欢在大便时带着一本书或者手机，看小说、玩游戏，大便时间过长，长此以往很可能造成肛裂。