真菌感染引起的灰指甲也是甲癣，在临床用药之前需要做真菌镜检以及培养，检测出相应孢子以及菌丝，明确诊断后再进行下一步的用药。如果是比较表浅的甲癣，可以外用盐酸阿莫罗芬搽剂进行治疗，在治疗前可以用锉刀轻轻的磨平指甲，再应用药液进行点滴，或者加大力度应用封包的治疗方式选择治疗。如果指甲累及较多，需要口服伊曲康唑胶囊联合百癣夏塔热胶囊，同时外用盐酸特比萘芬凝胶或者萘替芬酮康唑软膏，杀灭真菌治疗。