女性结石形成的原因和男性并没有太多区别，影响结石形成的因素很多，年龄、性别、种族遗传、环境因素、饮食习惯和职业对结石的形成影响很大。身体的代谢异常、尿路梗阻、感染、异物和药物的使用是结石形成的常见原因，重视这些问题能够减少结石的形成和复发。
常见的代谢异常包括尿酸碱度异常、高钙血症、高钙尿症、高草酸尿症、高尿酸血症、胱氨酸尿症、低枸橼酸尿症、低镁尿症。局部因素包括尿路梗阻、感染和尿路中存在异物是诱发结石形成的主要局部因素，梗阻可以导致感染和结石形成，而结石本身也是尿路中的异物，后者会加重梗阻及感染的程度。
药物相关因素分为两大类：一类为尿液浓度高而溶解度比较低的药物，如氨苯蝶啶；另一类为能够诱发结石形成的药物，如乙酰唑胺、维生素D等，这些药物在代谢的过程中导致了其它成分结石的形成。